沿革
創 設
第38回国会において、「学校教育法の一部を改正する法律」（昭和36年6月17日法律第14号）が成立し、我が国の産業発展に寄与するための技術者養成を使命とする高等専門学校が新たな学校制度として昭和37年度より発足することとなった。
函館市を中心とした地元の高等専門学校誘致の熱望に応え、昭和37年1月10日、文部省は函館市に機械工学科、電気工学科、土木工学科の３学科よりなる高等専門学校を設置することを決定、発表した。
昭和37年1月17日、文部大臣裁定による北海道大学長、北海道知事、函館市長よりなる函館工業高等専門学校設置準備委員会が設置され、これより先、すでに函館市が中心となって結成されていた函館工業高等専門学校設置期成会（会長 函館市長）と協力して昭和37年4月1日の開校準備に当たった。
昭和37年4月1日、函館市千代台町にあった旧陸軍施設（直前には市立中央中学校の校舎として利用されていた。）を仮校舎として発足した。
沿 革
| 昭和37年 | 4月1日 | 函館工業高等専門学校設置 初代校長に北海道大学名誉教授 理学博士 太秦 康光 就任 |
| 4月20日 | 開校式並びに第1回入学式挙行 | |
| 12月10日 | 新校舎新設第1期工事竣工 | |
| 39年 | 11月21日 | 校舎落成記念式典挙行 |
| 41年 | 4月1日 | 工業化学科設置 |
| 42年 | 3月16日 | 第1回卒業式挙行 |
| 45年 | 3月26日 | 図書館竣工 |
| 46年 | 12月6日 | 教育用電子計算機室竣工 |
| 47年 | 10月19日 | 開校10周年記念式典挙行 |
| 50年 | 4月1日 | 初代校長 太秦 康光 退官 |
| 4月3日 | 二代校長に北海道大学名誉教授 工学博士 武谷 愿 就任 | |
| 57年 | 11月2日 | 創立20周年記念式典挙行 |
| 58年 | 4月1日 | 二代校長 武谷 愿 退官 |
| 4月1日 | 三代校長に北海道大学名誉教授 理学博士 神原 富民 就任 | |
| 59年 | 3月15日 | 福利会館竣工 |
| 62年 | 10月9日 | 創立25周年記念式典挙行 |
| 平成元年 | 4月27日 | 三代校長 神原 富民 逝去 |
| 7月1日 | 四代校長に北海道大学名誉教授 理学博士 伊藤 英治 就任 | |
| 3年 | 4月1日 | 情報工学科設置 |
| 6年 | 3月31日 | 四代校長 伊藤 英治 退官 |
| 4月1日 | 五代校長に北海道大学名誉教授 Ph.D 延與 三知夫 就任 | |
| 7年 | 4月1日 | 土木工学科を環境都市工学科へ改組 |
| 8年 | 4月1日 | 工業化学科を物質工学科へ改組 |
| 11年 | 3月31日 | 五代校長 延與 三知夫 退官 |
| 4月2日 | 六代校長に北海道大学名誉教授 薬学博士 東 市郎 就任 | |
| 12月22日 | 低学年講義棟増築工事竣工 | |
| 12年 | 4月1日 | 電気工学科を電気電子工学科に改称 |
| 12月1日 | 技術室設置 | |
| 13年 | 7月1日 | 技術相談室設置 |
| 14年 | 3月28日 | 寄宿舎改修第１期工事竣工（女子寮設置） |
| 校内ＬＡＮシステム導入 | ||
| 9月20日 | 物質工学棟改修工事竣工 | |
| 15年 | 3月20日 | 創造工房設置 |
| 16年 | 3月5日 | 地域共同テクノセンター竣工 |
| 実験棟改修工事竣工 | ||
| 3月31日 | 六代校長 東 市郎 退官 | |
| 4月1日 | 独立行政法人に移行 | |
| 七代校長に北海道大学名誉教授 工学博士 長谷川 淳 就任 | ||
| 専攻科設置(生産システム工学専攻、環境システム工学専攻) | ||
| 18年 | 3月10日 | 専攻科棟新営工事竣工 |
| 屋内運動場改修工事竣工 | ||
| 19年 | 5月14日 | 「複合型システム工学」教育プログラムが 日本技術者教育認定機構（ＪＡＢＥＥ）の認定を受ける |
| 20年 | 3月27日 | 平成１９年度の独立行政法人大学評価 学位授与機構が実施した高等専門学校機構別認証評価において、 高等専門学校評価基準を満たしていることが認定された |
| 20年 | 4月1日 | 技術室を技術教育支援センターへ改組 |
| 21年 | 3月31日 | 七代校長 長谷川 淳 退官 |
| 4月1日 | 八代校長に北海道大学名誉教授 理学博士 岩熊 敏夫 就任 | |
| 22年 | 1月18日 | 学習支援室設置 |
| 24年 | 4月27日 | 「複合型システム工学」教育プログラムが 日本技術者教育認定機構（ＪＡＢＥＥ）の認定（継続）された |
| 10月12日 | 創立50周年記念式典挙行 | |
| 25年 | 4月1日 | 機械工学科,電気電子工学科,情報工学科を生産システム工学科に改組 物質工学科を物質環境工学科に改組 環境都市工学科を社会基盤工学科に改組 |
| 26年 | 4月1日 | キャリア教育センター、学習支援室及び学生相談室を統合。 総合学生支援センターに改組 |
| 27年 | 3月26日 | 平成26年度の独立行政法人大学評価・ 学位授与機構が実施した高等専門学校機関別認証評価において、 高等専門学校評価基準を満たしていることが認定された |
| 3月31日 | 八代校長 岩熊 敏夫 退任 | |
| 4月1日 | 九代校長に北海道大学名誉教授 工学博士 伹野 茂 就任 | |
| 29年 | 4月1日 | 国際交流センター設置 |
| キャリアセンター設置 | ||
| 30年 | 4月1日 | 専攻科生産システム工学と環境システム工学の2専攻を， 生産システム工学，物質環境工学，社会基盤工学の3専攻に改組。 |
| 令和2年 | 2月28日 | 図書館改修工事竣工 |
| 3年 | 4月26日 | 公立千歳科学技術大学と道内4高専の教育・研究等に関する包括連携 協定を締結 |
| 6月24日 | 国際寮新築工事竣工 | |
| 11月25日 | ソフトバンク株式会社と情報関連教育に関する連携協定を締結 | |
| 4年 | 1月27日 | 台湾聯合大学と国際交流協定を締結 |
| 3月24日 | 令和3年度の独立行政法人大学改革支援・学位授与機構 が実施した高等専門学校機関別認証評価において、 高等専門学校評価基準を満たしていることが認定された |
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| 4月1日 | 十代校長にPh.D 阿部 恵 就任 | |
| 9月20日 | 新モンゴル高専と国際交流協定を締結 | |
| 11月21日 | モンゴル工業技術大学付属高専と国際交流協定を締結 | |
| 12月5日 | ベルギー・ナミュール・リエージュ・ルクセンブルグ大学と 国際交流協定を締結 |
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| 5年 | 1月5日 | モンゴル国立科学技術大学付属高専と国際交流協定を締結 |
| 3月27日 | モンゴル科技大高専と国際交流に関する覚書（MOU）を締結 | |
| 4月1日 | KOSENコモンズセンター設置 | |
| 7月20日 | シンガポールのテマセクポリテクニックと国際交流に関する 覚書（MOU）を締結 |
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| 6年 | 11月29日 | 台湾の文藻外語大学と国際交流に関する覚書（MOU）を締結 |
| 7年 | 3月14日 | 公益財団法人日本工学教育協会による国立高専教育国際基準 （KIS）に認定された |
| 4月1日 | 十一代校長に室蘭工業大学名誉教授 工学博士 清水一道 就任 |
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| 9月27日 | 大樹町と包括連携協定を締結 | |
| 11月5日 | 北海道函館中部高校と包括連携協定を締結 | |
| 11月7日 | 北海道函館工業高校と包括連携協定を締結 |